Dehesa Colección:http://hdl.handle.net/10662/852024-03-19T13:24:14Z2024-03-19T13:24:14ZEpidemiología molecular de Mycobacterium tuberculosis en Ecuador: Diversidad genética de cepas presentes en el país y transmisión en zonas fronterizas con Colombia y PerúCastro Rodriguez, Bernardo Davidhttp://hdl.handle.net/10662/192892024-03-05T10:49:21Z2024-01-01T00:00:00ZTítulos: Epidemiología molecular de Mycobacterium tuberculosis en Ecuador: Diversidad genética de cepas presentes en el país y transmisión en zonas fronterizas con Colombia y Perú
Autores/as: Castro Rodriguez, Bernardo David
Resumen: La tuberculosis (TB) es una enfermedad infecciosa causada por bacterias del Complejo Mycobacterium
tuberculosis (MTBC). Nuestro estudio realizado en cepas de las provincias de El Oro y Esmeraldas, fronterizas con Perú y Colombia, respectivamente, encontró el predominio de cepas del linaje L4. Ambas zonas presentaron una elevada variabilidad genética y la ausencia de clústeres de transmisión activa. Además, hemos determinado la prevalencia de LAM- RDRio en Ecuador como la más baja de la región hasta la fecha (2.1%). Considerando los reportes de baja prevalencia de genotipos peligrosos como RDRio y Beijing (<1%) en Ecuador, es probable que estos valores cambien en la actualidad debido a la política de fronteras abiertas con Perú y Colombia que reportan prevalencias elevadas para ambos genotipos.
Por último, el diagnóstico rápido y diferencial de MTBC respecto a otras micobacterias no tuberculosas (NTM) es otro reto en los programas de vigilancia y control. En Ecuador se desconoce la incidencia y distribución de NTM. Nuestro estudio encontró que los kits comerciales basados en PCR de Viasure y Sansure, disponibles en Ecuador, presentan una sensibilidad variable del 75.6% al 94% para la detección de NTM.
En conclusión, los resultados de este estudio contribuyen al conocimiento de la distribución poblacional de las cepas de MTB en el país. Además, son estudios pioneros respecto a la vigilancia de TB en zonas de frontera. Finalmente, también se contribuye con información útil para el diagnóstico microbiológico de MTBC y NTM mediante la evaluación de algunas de las pruebas comerciales disponibles.; Tuberculosis (TB) is an infectious disease caused by bacteria of the Mycobacterium tuberculosis Complex (MTBC). Our study performed in strains from the provinces of El Oro and Esmeraldas, at the border with Perú and Colombia, respectively, found the predominance of strains from lineage L4. Both areas showed an increased genetic variability and the absence of active transmission clusters. Also, we determined the prevalence of LAM-RDRio in Ecuador as the lowest in the region to dato (2.1%).
Considering low prevalence reports of dangerous genotypes like RDRio and Beijing (<1%), it is probable
these values change in present days because of open-border policies with Peru and Colombia, countries that report high prevalence for both genotypes.
Finally, fast and differential diagnosis between MTBC and non-tuberculous mycobacteria (NTM) is another challenge in surveillance and control programs. Incidence and distribution of NTM are unknown in Ecuador. Our study found that Viasure and Sansure PCR-based commercial kits, currently available in Ecuador, present a variable sensibility between 75.6% and 94% when detecting NTM.
In conclusion, the results of this study contribute to the knowledge of the population distribution of MTB strains in Ecuador, as pioneer studies related to TB surveillance in border areas. Finally, it also contributes with useful information for the microbiological diagnosis of MTBC and NTM through the evaluation of some currently available commercial tests.
Descripción: Programa de Doctorado en Salud Pública y Animal; Tesis por compendio de publicaciones2024-01-01T00:00:00ZMecanismos moleculares de los efectos nocivos de la ingesta de aminoácidos oxidativos y nitrosados mediante ensayos "in vitro" e "in vivo"Díaz-Velasco Castela, Silviahttp://hdl.handle.net/10662/190842024-03-14T01:33:17Z2024-01-01T00:00:00ZTítulos: Mecanismos moleculares de los efectos nocivos de la ingesta de aminoácidos oxidativos y nitrosados mediante ensayos "in vitro" e "in vivo"
Autores/as: Díaz-Velasco Castela, Silvia
Resumen: El estrés oxidativo está asociado con múltiples enfermedades de origen intestinal, neurológico, metabólico y por supuesto, con el envejecimiento. Las proteínas oxidadas presentes en alimentos procesados y ultraprocesados, como en los productos cárnicos, entre otros, puede estar involucradas en este tipo de trastornos. En 2015, la Agencia Internacional de Investigación del Cáncer (IARC) determinó incluir dentro del
grupo 1 (su consumo causa cáncer) a los productos cárnicos procesados, y en el grupo 2A a la carne roja (su consumo probablemente causa cáncer), en base a estudios epidemiológicos. Los mecanismos moleculares subyacentes implicados en los daños causados por estos aminoácidos estaban por esclarecerse. Para ello, en la presente Tesis Doctoral, se estudiaron mediante técnicas moleculares avanzadas como la proteómica,
dos aminoácidos, uno oxidado y otro nitrosado, tanto de manera separada como en combinación con un compuesto fenólico, para contrastar sus hipotéticos beneficios frente a los posibles efectos perjudiciales causados por los aminoácidos oxidados/nitrosados. Los ensayos se realizaron exponiendo estos compuestos, tanto en dos tipos de cultivos celulares (modelos in vitro), como en ratones (modelo in vivo) a dosis encontradas en alimentos. Los estudios mostraron que los aminoácidos estudiados provocan estrés oxidativo tanto en cultivos celulares como en animales, incrementándose además las condiciones pro-oxidantes en combinación con el compuesto fenólico. Por lo tanto, queda demostrado que el estudio de los mecanismos moleculares subyacentes en este tipo de compuestos, presentes en alimentos, es de suma importancia a causa de las consecuencias perjudiciales para la salud.; Oxidative stress is associated with multiple disorders, such as gastrointestinal diseases, neurological disorders, metabolic syndromes and, certainly, with aging. Oxidized proteins, present in processed and ultra-processed foods, such as meat products, among others, may be involved in these pathologies. In 2015, the
International Cancer Research Agency (IARC) determined to include processed meat products in group 1 (their consumption causes cancer) and red meat in group 2A (their consumption probably causes cancer), based on epidemiological studies. The underlying molecular mechanisms involved in the harmful effects caused by these oxidized amino acids need to be clarified. For this purpose, in the present PhD Thesis, two amino acids,
one oxidized and the other nitrosated, were studied using advanced molecular techniques such as proteomics, both separately and in combination with a phenolic compound, to contrast its hypothetical benefits against the possible toxicological effects as a consequence of the exposure to these oxidized/nitrosated amino acids. The studies were performed exhibiting these compounds, both in two types of cell cultures (in vitro models) and in mice (in vivo model) at food-compatible doses. Studies revealed that these oxidized/nitrosated amino acids cause oxidative stress in both cell cultures and animals, also increasing pro-oxidant conditions in combination with the phenolic compound. Therefore, is evidence that the study of the underlying molecular mechanisms of such compounds, present in food, has a crucial importance due to the harmful consequences for health.
Descripción: Programa de Doctorado en Ciencias de los Alimentos2024-01-01T00:00:00ZEstudio de los mecanismos fisiopatológicos del consumo sostenido de fructosa y del efecto protector de un extracto de granada en ratas Wistar mediante el uso de técnicas ómicasSánchez Terrón, María Guadalupehttp://hdl.handle.net/10662/190832024-03-05T10:15:03Z2024-01-01T00:00:00ZTítulos: Estudio de los mecanismos fisiopatológicos del consumo sostenido de fructosa y del efecto protector de un extracto de granada en ratas Wistar mediante el uso de técnicas ómicas
Autores/as: Sánchez Terrón, María Guadalupe
Resumen: Algunos de los compuestos que ingerimos normalmente, como los azúcares reductores, promueven la aparición de estrés oxidativo en el lumen del tracto gastrointestinal (GIT, del inglés gastrointestinal tract). Es conocido el papel que el estrés oxidativo promovido in vivo tiene sobre diversos procesos patológicos en el GIT, como algunos tipos de cánceres gastrointestinales, colitis ulcerosa, enfermedad de Crohn, u otras enfermedades inflamatorias del intestino. El consumo de azúcares reductores favorece el aumento del estrés oxidativo luminal. La relación entre el aumento del consumo de azúcares reductores, como la fructosa, entre la población, así como la alta prevalencia de enfermedades metabólicas, como obesidad, hipertrigliceridemia, esteatosis hepática no alcohólica o enfermedad del hígado graso no alcohólico (NAFLD, del inglés non-alcoholic fatty liver disease), resistencia a la insulina o diabetes, entre otras, es un tema que preocupa enormemente a las autoridades sanitarias. Por esto, el conocimiento de los mecanismos que promueven el inicio y/o el desarrollo de estas patologías bajo consumos elevados de azúcares resulta imprescindible en
el avance sobre estrategias nutricionales que permitan disminuir el efecto dañino.
Por otro lado, las proteínas de los alimentos que ingerimos son objetivo del estrés oxidativo luminal, y su interacción con los radicales libres podría dar lugar a la formación de compuestos no deseados cuyas consecuencias para los consumidores permanecen aún sin esclarecerse. La formación de estos compuestos en cualquiera de las fases de la digestión hace que el GIT y el resto de los órganos implicados en la asimilación de los alimentos queden expuestos al potencial efecto tóxico y mutagénico de algunas de estas especies. En la presente tesis doctoral, se ha evaluado cómo la presencia de glucosa y fructosa afecta a la digestibilidad de las proteínas durante su digestión, mediante un modelo in vitro de digestión y un ensayo in vivo en el que se analizaron los contenidos gastrointestinales de ratas Wistar expuestas a un consumo elevado de fructosa en el agua de bebida durante 10 semanas. Así mismo, en el experimento in vivo, se analizaron los tejidos gastrointestinales y hepático, así como el suero y la orina de los animales expuestos tanto a la suplementación con fructosa como a una suplementación con un extracto de granada rico en
punicalagina. Las técnicas avanzadas utilizadas en la presente tesis doctoral han permitido analizar las bases de los mecanismos fisiopatológicos en los que se ve involucrada la fructosa y el efecto beneficioso del suplemento rico en punicalagina sobre la fisiopatología de los animales.; Some of the compounds we commonly ingest, such as reducing sugars, promote the onset of oxidative stress in the lumen of the gastrointestinal tract (GIT). The role of the in vivo-promoted oxidative stress in several pathologies within the GIT, including gastrointestinal cancers, ulcerative colitis, Crohn’s disease, or other inflammatory bowel diseases, is well known. The consumption of reducing sugars, such as fructose, promotes the increase of luminal oxidative stress. The association between increased reducing sugars consumption among the population and the high prevalence of metabolic diseases such as obesity, hypertriglyceridemia, non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD), insulin resistance, or diabetes is a matter of great concern for health authorities.
Therefore, understanding the mechanisms that promote the onset and/or development of the pathologies related to high sugars consumption is essential for improving nutritional strategies to reduce the harmful effects. On the other hand, the food proteins we ingest are targets of the luminal oxidative stress, and their
interaction with free radicals could lead to the formation of undesired compounds whose consequences for consumers remain unclear. The formation of these compounds in any phase of the digestion exposes the GIT and other organs to the potential toxic and mutagenic effects of some of these species. In this doctoral thesis, we assessed how the presence of glucose and fructose affects protein digestibility during digestion, using an in vitro digestion model and an in vivo assay in which the gastrointestinal contents of Wistar rats exposed to high fructose consumption in drinking water for 10 weeks were analyzed. Likewise, in the in vivo experiment, the gastrointestinal and hepatic tissues, as well as the serum and the urine from animals exposed to both fructose supplementation and supplementation with a punicalagin-rich pomegranate extract, were analyzed. The advanced techniques employed in this doctoral thesis have allowed for an analysis of the physiopathological
mechanisms involving fructose and the beneficial effects of the polyphenol-rich supplement on the
physiopathology of the animals.
Descripción: Programa de Doctorado en Ciencia de los Alimentos2024-01-01T00:00:00ZDiseño y control de un exosuit basado en sinergias para asistir la marcha en el tren inferiorJayakumar, Ashwinhttp://hdl.handle.net/10662/188432024-03-05T13:02:19Z2023-01-01T00:00:00ZTítulos: Diseño y control de un exosuit basado en sinergias para asistir la marcha en el tren inferior
Autores/as: Jayakumar, Ashwin
Resumen: Según el estudio más reciente de la Organización de las Naciones Unidas publicado en 20191, la población de mayores de 65 años de edad era de 9%, una cifra que puede alcanzar el 16% en el año 2050. El envejecimiento causa problemas de movilidad: los músculos pierden fuerza, las articulaciones se estresan y el cuerpo en general se vuelve más lento que antes. Esta tesis pretende contribuir en los objetivos de Desarrollo Sostenible, concretamente en el 3: "Garantizar una vida sana y promover el bienestar para todos en todas las edades". Por ello, en esta tesis se aborda el diseño de un exoesqueleto vestible también conocido como exosuit, con la intención de ayudar a la marcha del usuario. El prototipo inicial estará diseñado para mayores con movilidad reducida o con problemas en su marcha. El exosuit será diseñada a base de sinergias cinemáticas, consistentes en una codificación de la información contenida en la cinemática del sujeto de manera que se pueda reducir el número de actuadores por pierna, reduciendo los requerimientos de la actuación y el peso del dispositivo. Los problemas que se abordan en esta tesis son la implementación de sinergias cinemáticas en un exosuit con motores y cables, detección de la marcha, y optimización del esquema total de control. Primero, se planteará el diseño de un banco de pruebas para ensayar varias opciones de montaje y esquemas de control. Una vez se obtiene una solución apropiada, se trasladarán estos conceptos a la construcción de un exotraje de tren inferior, analizándose su funcionamiento.; According to the most recent report by the United Nations dated 20192, the world population above the age of 65 years was 9%, a number that was projected to hit 16% by the year 2050. Ageing tends to give rise to problems in mobility as muscles become weaker, joints become stressed, and the body itself slows down overall. This thesis aims to contribute to the third part of ’Sustainable Development’: Ensure healthy living and promote wellness for all at all ages. It describes the design of a soft exoskeleton otherwise known as an exosuit, with the aim of aiding the mobility of the wearer. The initial prototype will be directed to help elderly people who have reduced mobility and/or abnormal gait. The entire exosuit will be designed around on the basis of kinematic synergies, which decodes the information contained in the subject’s kinematics so as to reduce the number of actuators per leg, thereby reducing the overall requirements for actuation and the total weight of the device. The primary challenges of the project will be the implementation of kinematic synergies in an exosuit driven by motors and cables, detection of gait phases as well as optimizing the total control scheme. As a precursor, a modular test bench will be designed to facilitate testing of various types of mounting options and control schemes. Once an appropriate solution is achieved, the same will be implemented to construct a prototype exosuit and its effectiveness will be evaluated.
Descripción: Tesis por compendio de publicaciones. Programa de Doctorado en Ingenierías Industriales2023-01-01T00:00:00Z