Endocarditis con hemocultivos negativos en Extremadura. Papel de las técnicas de alta resolución en el diagnóstico etiológico

Abstract

INTRODUCCIÓN: En la endocarditis infecciosa (EI) el hemocultivo no siempre es diagnóstico. La negatividad puede ser debida a bacterias zoonóticas. El presente trabajo analiza el perfil de la EI en Extremadura y evalúa la aplicación de técnicas de nueva secuenciación genética (NGS) en el diagnóstico etiológico. MATERIAL Y MÉTODO: I. Estudio retrospectivo de 302 pacientes con EI atendidos en el Hospital Universitario de Badajoz (1990-2015). II. Estudio prospectivo con análisis de NGS sobre 7 válvulas cardiacas de pacientes intervenidos en el mismo centro. RESULTADOS: I. Las EI con hemocultivos negativos son el 23%, las zoonosis casi el 7% y en el 13% no se alcanzó el diagnóstico etiológico. El perfil global mostró un aumento progresivo de: edad media, adquisición nosocomial, EI sobre cable e intervenidas quirúrgicamente. II. Los 6 pacientes con EI tenían hemocultivos positivos monomicrobianos, excepto un caso. Mediante NGS se confirmó la presencia de las bacterias cultivadas en sangre y, además, una media de 10 géneros bacterianos por muestra: los 3 clásicos, 13 descritos como causa de EI, 4 no descritos y 2 no patógenos humanos conocidos hasta ahora. En la válvula no endocardítica se encontró material bacteriano. CONCLUSIONES: 1. El perfil de la muestra estudiada es similar a lo descrito. 2. El porcentaje de bacterias zoonóticas es mayor al del entorno. 3. Las técnicas microbiológicas disponibles son insuficientes para obtener un diagnóstico etiológico en todos los casos. 4. La aplicación de NGS en las válvulas cardíacas mejorará el rendimiento diagnóstico.

INTRODUCTION: Blood culture often fail to achieve diagnosis in infectious endocarditis (IE). Endemic zoonotic bacteria may explain negative blood cultures. This study analyses IE profile in Extremdura and assess the role of next generation sequencing (NGS) for etiological diagnosis. MATERIAL AND METHOD: I. Retrospective study including 302 patients with IE, admitted at University Hospital of Badajoz (1990-2015). II. Prospective study analyzing heart valves samples by NGS from 7 operated patients at the same hospital. RESULTS: I. Negative blood culture IE were 23%, zoonosis nearly 7% and 13% failed to achieve etiological diagnosis. Global profile showed a progressive increase of: median age, nosocomial acquisition, intracardiac device IE and surgical treatment. II. Six IE patients had positive monomicrobial blood culture, except in one case. Presence of cultured bacteria was confirmed through NGS and also a median of 10 bacterial genera by sample: 3 classical genera, 13 reported as causing IE, 4 unreported and 2 unkown human pathogens. One sample from a patient without IE also revealed bacteria. CONCLUSIONS: 1. IE profile from the poblational sample is similar to reported data. 2. Zoonotic bacteria percentage is greater than reported in other areas. 3. Available microbiologic tests fail to achive etiological diagnosis in all IE cases. 4. NGS in explanted heart valves would provide an insight through real bacterial presence.