Endocarditis con hemocultivos negativos en Extremadura. Papel de las técnicas de alta resolución en el diagnóstico etiológico

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Endocarditis con hemocultivos negativos en Extremadura. Papel de las técnicas de alta resolución en el diagnóstico etiológico

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dc.contributor.advisor Muñoz Sanz, Agustín es_ES
dc.contributor.author Calvo Cano, Antonia María es_ES
dc.contributor.other Universidad de Extremadura. Departamento de Ciencias Biomédicas es_ES
dc.date.accessioned 2018-07-31T08:56:04Z
dc.date.available 2018-07-31T08:56:04Z
dc.date.issued 2018-07-31
dc.date.submitted 2018-07-12
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/10662/7789
dc.description.abstract INTRODUCCIÓN: En la endocarditis infecciosa (EI) el hemocultivo no siempre es diagnóstico. La negatividad puede ser debida a bacterias zoonóticas. El presente trabajo analiza el perfil de la EI en Extremadura y evalúa la aplicación de técnicas de nueva secuenciación genética (NGS) en el diagnóstico etiológico. MATERIAL Y MÉTODO: I. Estudio retrospectivo de 302 pacientes con EI atendidos en el Hospital Universitario de Badajoz (1990-2015). II. Estudio prospectivo con análisis de NGS sobre 7 válvulas cardiacas de pacientes intervenidos en el mismo centro. RESULTADOS: I. Las EI con hemocultivos negativos son el 23%, las zoonosis casi el 7% y en el 13% no se alcanzó el diagnóstico etiológico. El perfil global mostró un aumento progresivo de: edad media, adquisición nosocomial, EI sobre cable e intervenidas quirúrgicamente. II. Los 6 pacientes con EI tenían hemocultivos positivos monomicrobianos, excepto un caso. Mediante NGS se confirmó la presencia de las bacterias cultivadas en sangre y, además, una media de 10 géneros bacterianos por muestra: los 3 clásicos, 13 descritos como causa de EI, 4 no descritos y 2 no patógenos humanos conocidos hasta ahora. En la válvula no endocardítica se encontró material bacteriano. CONCLUSIONES: 1. El perfil de la muestra estudiada es similar a lo descrito. 2. El porcentaje de bacterias zoonóticas es mayor al del entorno. 3. Las técnicas microbiológicas disponibles son insuficientes para obtener un diagnóstico etiológico en todos los casos. 4. La aplicación de NGS en las válvulas cardíacas mejorará el rendimiento diagnóstico. es_ES
dc.description.abstract INTRODUCTION: Blood culture often fail to achieve diagnosis in infectious endocarditis (IE). Endemic zoonotic bacteria may explain negative blood cultures. This study analyses IE profile in Extremdura and assess the role of next generation sequencing (NGS) for etiological diagnosis. MATERIAL AND METHOD: I. Retrospective study including 302 patients with IE, admitted at University Hospital of Badajoz (1990-2015). II. Prospective study analyzing heart valves samples by NGS from 7 operated patients at the same hospital. RESULTS: I. Negative blood culture IE were 23%, zoonosis nearly 7% and 13% failed to achieve etiological diagnosis. Global profile showed a progressive increase of: median age, nosocomial acquisition, intracardiac device IE and surgical treatment. II. Six IE patients had positive monomicrobial blood culture, except in one case. Presence of cultured bacteria was confirmed through NGS and also a median of 10 bacterial genera by sample: 3 classical genera, 13 reported as causing IE, 4 unreported and 2 unkown human pathogens. One sample from a patient without IE also revealed bacteria. CONCLUSIONS: 1. IE profile from the poblational sample is similar to reported data. 2. Zoonotic bacteria percentage is greater than reported in other areas. 3. Available microbiologic tests fail to achive etiological diagnosis in all IE cases. 4. NGS in explanted heart valves would provide an insight through real bacterial presence. en_US
dc.format.extent 157 p. es_ES
dc.format.mimetype application/pdf en_US
dc.language.iso spa es_ES
dc.rights Atribución-NoComercial-SinDerivadas 3.0 España *
dc.rights.uri http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/3.0/es/ *
dc.subject Endocarditis bacteriana es_ES
dc.subject Enfermedades de las válvulas cardíacas es_ES
dc.subject Secuenciación de alto rendimiento de nucleótidos es_ES
dc.subject Endocarditis / diagnosis en_US
dc.subject Heart valves / microbiology en_US
dc.subject High-throughput nucleotide sequencing en_US
dc.title Endocarditis con hemocultivos negativos en Extremadura. Papel de las técnicas de alta resolución en el diagnóstico etiológico es_ES
dc.type doctoralThesis es_ES
europeana.type TEXT en_US
dc.rights.accessRights openAccess es_ES
dc.subject.unesco 2414.08 Procesos Microbianos es_ES
dc.subject.unesco 2415.02 Biología Molecular de Plantas es_ES
dc.subject.unesco 3205.05 Enfermedades Infecciosas es_ES
europeana.dataProvider Universidad de Extremadura. España es_ES


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